Το Εποπτικό Συμβούλιο αποτελείται από τον Πρόεδρο και δύο (2) μέλη. Εκλέγεται από την Γενική Συνέλευση των μελών μαζί με το Διοικητικό Συμβούλιο. Εκλέγεται και ένας (1) Αναπληρωτής. Στο Εποπτικό Συμβούλιο ανατίθεται ο έλεγχος και εποπτεία της διαχειρίσεως του Διοικητικού Συμβουλίου. Ελέγχει την τήρηση του Καταστατικού και των αποφάσεων της Γενικής Συνέλευσης, εξετάζει τα βιβλία, έγγραφα και διαχειριστικά στοιχεία του Ινστιτούτου αλλά και την οικονομική κατάσταση του Ινστιτούτου. Το Εποπτικό Συμβούλιο συντάσσει έκθεση προς την ετήσια Γενική Συνέλευση επί των θεμάτων αρμοδιότητάς της, καθώς και το πόρισμα του ελέγχου.
Το Εποπτικό Συμβούλιο του Ινστιτούτου αποτελείται τους:
- Πρόεδρος: Κορρές Γεώργιος, Καθηγητής Πανεπιστημίου Αιγαίου
- Μέλος: Αργυρόπουλος Ηλίας, Phd, Εκπαιδευτικός
- Μέλος: Ρίζου Βασιλική, Εκπαιδευτικός